分享好友 最新动态首页 最新动态分类 切换频道
一文读懂差示扫描荧光法(DSF)
2024-11-07 22:28
​​

差示扫描荧光法(Differential Scanning Fluorimetry, 简称DSF),是在荧光定量PCR仪上缓慢加热样品,在加热的过程中检测荧光染料与结构发生改变的蛋白质相结合的量,来评价蛋白质热稳定性的方法。该方法具有蛋白样品损耗少、通量高、温度变化范围广及数据准确等优点,被广泛用于蛋白质稳定性(蛋白质热稳定性参数及其影响因素)、蛋白结构和构象、蛋白-配体相互作用及蛋白质稳定剂、抑制剂、辅助因子等领域的研究。

一文读懂差示扫描荧光法(DSF)

01DSF原理

02 

DSF测试过程

1、仪器准备 

DSF 主要是利用荧光定量 PCR 仪在 96 孔或 384 孔 PCR 板上完成平行检测,以实现高通量筛选目的蛋白和化合物。

2、样品准备

蛋白样品需要较高的纯度(~75%),化合物的纯度通过 LC-MS 质检;SYPRO Orange 是目前DSF实验中应用最广泛的染料,方便且高效。此外,也有一些特殊的染料用于特定蛋白的研究,例如 1,8-ANS、2,6-ANS、2,6-TNS、oxazole 系列和 BODIPY、BFC 系列染料探针。

3、反应体系配置

根据实验设计把蛋白和配体配置成不同浓度的体系,置于 96 孔板或 384 孔板。缓冲液可以根据实际需要进行更换。DSF 的反应体系主要包括蛋白样品、反应缓冲液、荧光染料及候选的化合物配体,每检测孔样品体积为 20~25 µL,以蛋白缓冲液作为空白对照,每个检测组设三组重复。

4、上机

将上述配置好的体系放入荧光定量 PCR 仪中,激发和发射波长分别调至荧光染料相应波长, 升温速率通常设为 1 ℃/10s,温度变化范围一般从 25 ℃ 到 75 ℃ 或 100 ℃ 不等,每 1~3 ℃ 测定一次荧光强度(实验条件会根据实际情况优化)

5、数据分析

通过数据处理软件,绘制出荧光强度随温度的变化曲线,通过拟合波尔兹曼(Boltzmann transport equation,BTE)方程,计算出蛋白样品的 Tm 值及相关参数。

03 

DSF优点

1、Nano DSF无需染料:直接检测蛋白紫外荧光;

2、初步或者大量检测蛋白与化合物之间是否有结合力;

3、低样品消耗量:每个样品仅需10 μL,最低浓度仅需0.5 μg/mL;

4、数据精度高:CV<0.1% (Tm);

5、温度变化范围广。

04 

DSF应用

1、蛋白质稳定性评估

2、蛋白质结构研究

蛋白质结晶是研究蛋白质结构的一个非常重要的手段,DSF可以高通量筛选蛋白质的结晶条件。

3、蛋白质-配体相互作用研究

配体与蛋白质结合一般会导致蛋白质的热稳定性改变,DSF可以通过测定蛋白质的热稳定性参数评估配体与蛋白质之间的相互作用。

4、蛋白质稳定剂、抑制剂的高通量筛选  

5、小分子化合物抑制机制研究  

利用 DSF 可以进行高通量、矩阵式的多种化合物检测(化合物与一些已知的抑制剂、底物、产物或辅助因子等结合),用于小分子化合物抑制剂的筛选及其药理机制的研究。

最新文章
2023-2029年中国脂肪醇行业市场竞争态势及发展趋向分析报告
脂肪醇是合成醇系表面活性剂的主要原料,按原料来源不同又分为合成醇和天然醇。由石油为原料制备合成醇的路线很多,但目前已在工业上形成大吨位生产的路线主要有三条:1.几基合成醇,该法在羰基化催化剂接触下,将烯烃和一氧化碳、氢气反应,
seo综合查询是啥意思(seo综合查询工具可以查看哪些数据)
SEO中有一个很重要的知识点就是要在页面中布局关键词,那么在布局关键词时,往往给出的要求是“查找用户爱搜索的词”,并进行布局。那么如何查找用户爱搜索的关键词呢?1.搜索引擎下拉框我们在搜索框中输入相应关键词时,系统往往会在下拉
AI智能脱口秀文案生成工具:一键打造爆笑子与幽默桥,全面满足创作需求
AI智能脱口秀文案生成工具:一键打造爆笑子与幽默桥,全面满足创作需求在信息时代飞速发展的今天人工智能已经渗透到咱们生活的方方面面甚至连幽默与创意也不例外。你是不是曾经为创作脱口秀子而头痛不已绞尽脑汁却依然无法捕捉到那些让人捧
1000个箭头(ai源文件,可编辑)在此,绘图必备!
免费资源:一、国自然类:1 2023历年国自然标书全文3国自然项目答辩PPT5标书写作模板7 国自然项目造假清单22018-24年国自然清单4 基金插图素材(可编辑)6 ‍近10年国自然标书全文‍二、SCI生信+实验类:1 160套SCI实验操作视频3Meta分析范
交通银行:启动新一代集团信息系统智慧化转型工程
  中国网财经8月16日讯 交通银行16日在银行业例行新闻发布会上介绍了该行加速推进信息技术智慧化转型的相关情况。交通银行副行长沈如军表示,日前,交通银行正式启动新一代集团信息系统智慧化转型工程(“新531”工程),目的是以打造数字
抖音短视频什么时间段发布最多人看?抖音流量时间段分析
三、注意事项其实,选择视频发布的时间对流量的影响虽然很重要,但是我们也不可忽视视频的内容质量,一个优质的视频可以轻松帮助我们登上热门。那如何产生优质的内容呢,我们可以从以下两点出发:1)素材来源 内容是重中之重。但是创造优质
11个帮助站长提升网站搜索引擎自然流量的SEO技巧
怎样提高你的百度搜索引擎提升专业技能?能够小范畴的试着一下这一明细里边的SEO专业技能,她们全是行得通并便于了解的百度搜索引擎提升专业技能。绝大多数的SEO专业技能明细都很模糊不清:对的…点“回到”按键。在本文中,大家将清除模棱
9月20日,百万美国人打算解救51区的外星Homie
美国最热话题是,一群哥们儿要抱团冲进美国神秘的军事基地51区,活捉外星人。什么叫51区,杰个话题都快被他吗说烂了,简单带你复习一下:美国政府储藏1947年罗斯威尔不明飞行物坠毁残骸和地外生物尸体的仓库,以及和外星人签订研究外星科技
2024流行的1一4多人游戏有哪些 好玩的多人游戏排行榜
多人游戏随着发展目前已经成为了众多游戏玩家们的圣地,这种游戏类型不仅仅只是注重玩家的个人技术,更是对玩家们的心理素质以及团队协作的终极挑战,2024流行的1一4多人游戏有哪些,介绍的游戏将会给玩家带来阵阵令人心跳加速的快感,同时
2005年以来国内成品油历次调价一览表
三次成品油定价机制改革自1998年迄今,中国已经历了三次成品油定价机制改革。1998年6月3日,原国家计委出台《原油成品油价格改革方案》,规定中石油和中石化两个集团公司之间原油交易结算价格由双方协商确定,价格由原油基准价和贴水两部分
相关文章
推荐文章
发表评论
0评